Die Pfarr- und Klosterkirche St. Johannes in Rebdorf gehört in ihrem romanischen Kern zu den ältesten Gotteshäusern der Stadt Eichstätt. Nach Gründung des Augustiner Chorherrenstifts durch den Eichstätter Bischof Konrad von Morsbach (um 1156) wurde in der 2. Hälfte des 12. Jh., die Kirche in Form einer romanischen Pfeilerbasilika erbaut; die Türme wurden in der 1. Hälfte des 13. Jh. errichtet. Nach Umbauten in der Zeit der Gotik wird das heutige Erscheinungsbild vor allem durch die barocken Umgestaltungen durch Matthias Seybold (1732 – 1734) geprägt. Der festliche Stuck von hoher Qualität und die Fresken von Josef Dietrich beeindrucken jeden Besucher. Nach der Säkularisation diente die Kirche ca. hundert Jahre als Anstaltskirche des in Rebdorf untergebrachten Arbeitshauses und wurde aller beweglichen Einrichtungsgegenstände beraubt. Nach der Übernahme des Klosters durch die Herz-Jesu-Missionare 1959 wurde die Kirche 1961 – 1963 renoviert. Über dem modernen Hochaltar zieht heute eine spätgotische Kreuzigungsgruppe von Andreas Frosch (1519) den Blick auf sich. Sehenswert sind außerdem eine spätgotische Madonna auf dem linken Seitenaltar sowie ein klassizistischer Altar im rechten Seitenschiff. Neu beschafft wurden 1979 die Orgel und 1989 vier zusätzliche Glocken. Rebdorf wurde 1972 zur Kuratie und 1981 zur Pfarrei erhoben.

Die Pfarrkirche St. Johannes der Evangelist in Obereichstätt ist romanischer Herkunft und über 850 Jahre alt. Sie war einst Wehrkirche. Ihr Inneres behütet das großartige "Rebdorfer Kreuz" aus dem 15. Jhdt.. Es wurde nach der Säkularisation von Rebdorf hierher gebracht. Der schöne Taufstein trägt die Jahreszahl 1619.

Zum Kinderdorf Marienstein der Caritas gehört die Kirche Mariä Heimsuchung. Das moderne Gebäude in Holzbauweise wurde von den Münchner Architekten Eckert, Pressl und Jakobik errichtet und 1976 vom Bischof Alois Brems geweiht.